Le Conseil de l'UE dispose de compétences législatives et budgétaires :

• il adopte la législation européenne proposée par la Commission européenne, dans la plupart des domaines en commun avec le Parlement européen selon la procédure législative ordinaire (anciennement dite de "codécision") ;
• il contribue à la coordination des politiques économiques générales des États membres ;
• il dispose d’une compétence d’exécution dans des cas spécifiques (art. 291 TFUE) et en ce qui concerne la politique étrangère et de sécurité commune (art. 24 et 26 TUE) ;
• il partage le pouvoir budgétaire avec le Parlement ;
• il conclut au nom de l’Union les accords internationaux entre celle-ci et d’autres États ou organisations internationales ;
• il prend les décisions nécessaires à la définition et à la mise en œuvre de la PESC, d’après les orientations générales définies par le Conseil européen.

Les modalités de prise de décision du Conseil de l’Union européenne varient selon le domaine concerné.

Le vote à la majorité qualifiée s'applique aux décisions relevant de la procédure législative ordinaire, qui sont les plus nombreuses (80%). Ces décisions concernent le marché intérieur, les politiques de visas, la coordination des politiques économiques, les politiques monétaires, la politique sociale, l’éducation, la santé, l’environnement, l’aide au développement, la recherche.

La majorité qualifiée est également appelée double majorité, puisqu'il s'agit de recueillir celle des États et celle des citoyens. Ainsi :

• une proposition de la Commission doit être soutenue par 55% des États membres représentant au moins 65% de la population totale de l'UE ; 
• les abstentions comptent comme un vote négatif ;
• si 24 États votent pour un texte, même sans atteindre le seuil de 65%, la majorité qualifiée est réputée acquise ;
• cependant, si quatre États membres au moins s'opposent au vote, ils constituent une minorité de blocage.

La majorité simple s’applique :

• pour les décisions de procédure, telles que le règlement intérieur, l’organisation du secrétariat général du Conseil ou le statut des comités prévus par les traités ;
• pour inviter la Commission à réaliser des études ou présenter des propositions.

Le vote à l’unanimité s’applique :

• aux décisions les plus sensibles : PESC, financement de l'UE, citoyenneté, l'adhésion de nouveaux États membres...;
• pour amender une proposition de la Commission : il s’agit de s’assurer que si on s’éloigne de la proposition initiale, ce n’est pas au détriment de certains États membres, la Commission étant réputée représenter l'intérêt général ;
• à toute décision d’ordre constitutionnel (révision des traités, adhésion de nouveaux États, ressources propres du budget) ;
• lors d'un vote à l'unanimité, une abstention ne fait pas obstacle à l'adoption d'une décision.